近日，農業農村部南海漁業資源開發利用重點實驗室遺傳育種創新團隊對黃鰭棘鯛基因組解析的研究取得重要進展，相關研究成果在國際知名期刊Genomics上在線發表，朱克誠副研究員為論文第一作者，張殿昌研究員為通訊作者。該研究得到農業農村部財政專項、廣東省實驗室項目、中國-東盟海上合作基金等共同資助。
黃鰭棘鯛是華南咸淡水區域主要養殖的魚類之一，典型河口魚類，肉質細嫩，味道鮮美，深受消費者歡迎。但是，長期以來，黃鰭棘鯛野生苗種生長相對緩慢，亟待開展黃鰭棘鯛生長快、抗病能力強的新品種選育；繪制黃鰭棘鯛基因組精細圖譜，可為其重要經濟性狀的遺傳解析和全基因組選擇育種提供基礎數據。
重點實驗室張殿昌研究員團隊利用第二、三代測序和Hi-C染色體構象捕獲技術，構建了黃鰭棘鯛染色體水平的基因組圖譜，其基因組大小為806Mb，contig N50和scaffold N50分別達到2.60 Mb和30.2 Mb，利用Hi-C技術成功將90.8%的組裝序列掛載到24條染色體上，鑒定出19,631蛋白編碼基因，基因家族分析顯示ARRDC3 和 GSTA基因家族在廣鹽性的鯛科魚類中出現了大量擴張，為后續研究鯛科魚類滲透壓調節機制提供了重要參考。
論文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2021.04.017。
黃鰭棘鯛基因組序列圖譜
黃鰭棘鯛ARRDC3基因家族信息
